Search what you want

Sunday, March 29, 2015

Multiple Sequence Alignment [AlgorBio]

          Multiple Sequence Alignmet yaitu dimana kita membandingkan lebih dari dua sequence dan kita diminta untuk mendapatkan score maksimal dari satu set sequence setelah dibandingkan dengan sequence lain serta membuat profile. secara umum kita bisa mendapatkan nilai scoring dari MSA dengan rumus:

sedangkan ada dua metode untuk mendapatkan nilai S(mi):
1. Sum of Pair (SP) 
 
contoh soal:

2. Minimum Entropy
   
contoh soal:

No comments:

Post a Comment