Search what you want

Tuesday, March 31, 2015

Make Profile From Sequence [AlgorBio]

pada postingan kali ini aka dibahas cara membuat profile dari satu set sequence. apa sih gunanya profiling ini? ya, jika kita ingin meng-alignment sequence-sequence kitaa harus menghitungnya dengan metode-metode yang pernah kita bahas sebelumnya, mulai dari star method maupun progresive alignment. maka dari itu ketika kita telah menghitung satu set multiple kita lebih baik membuat profile dari alignment yang sudah ada, sehingga jika ada sequence baru yang akan di alignment, kita tidak perlu lagi mengihitung dari awal lagi menggunakan metode sebelumnya. berikut cara membuat profile dari satu set sequence:

dalam suatu kasus dimana sequence baru akan masuk. maka:

maka hasil akhirnya sebagai berikut:


No comments:

Post a Comment